Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm7945F6QI24 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms