Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cald1E9QA15 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cald1E9QA15 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms