Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC030500E9Q6W0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC030500E9Q6W0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms