Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r48E9Q5D8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms