Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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