Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
ApobE9Q414 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms