Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd1E9Q3H4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms