Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms