Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3095E9Q058 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms