Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fndc1E9Q043 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms