Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20425E9Q035 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms