Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4450E9Q007 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms