Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms