Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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