Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms