Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrt2E9PUL5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms