Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca3bE9PUL3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca3bE9PUL3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms