Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3543D3Z235 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm3543D3Z235 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3543D3Z235 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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