Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc8D3YZV8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms