Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo5D3YW29 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms