Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms