Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmf1B9EKI3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms