Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700006A11RikB9EHI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700006A11RikB9EHI3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms