Protein–RNA interactions for Protein: B6A8R8

Tarm1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarm1B6A8R8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tarm1B6A8R8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tarm1B6A8R8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms