Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apba1B2RUJ5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms