Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf518bB2RRE4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms