Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brpf3B2KF05 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms