Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ssxb8B1AY40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ssxb8B1AY40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb8B1AY40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb8B1AY40 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ssxb8B1AY40 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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