Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik3B1AS29 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik3B1AS29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms