Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttll11A4Q9F4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll11A4Q9F4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms