Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plcb2A3KGF7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plcb2A3KGF7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plcb2A3KGF7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Plcb2A3KGF7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Plcb2A3KGF7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plcb2A3KGF7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms