Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atp8b5A3FIN4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atp8b5A3FIN4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atp8b5A3FIN4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Atp8b5A3FIN4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Atp8b5A3FIN4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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