Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra4A2RT60 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms