Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef25A2ASI9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms