Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scn3aA2ASI5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms