Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms