Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm12A2AJ77 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms