Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdccag3A2AIW0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdccag3A2AIW0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms