Protein–RNA interactions for Protein: A2AE21

Zfp300, Zinc finger protein 300, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp300A2AE21 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms