Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprfA2A8L5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms