Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb4A2A863 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb4A2A863 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms