Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calcoco2A2A6M5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms