Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm27029A2A4P4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm27029A2A4P4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms