Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms