Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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