Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC173Q0VFZ6 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC173Q0VFZ6 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC173Q0VFZ6 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC173Q0VFZ6 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC173Q0VFZ6 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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