Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp1P55194 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp1P55194 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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