Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccl20O89093 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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