Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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