Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd11P23813 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms